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项目文章(Cancer Letters IF:10.1)|从糖代谢到表观遗传:肝癌进展的隐藏引擎

发布时间:2025-11-21
分解重程序设计是肿癌引发和新进展的因素,提子糖分解的优化起着主要效果。各种改变使肿癌组织人体细胞并能高效得到 养分并生成都要的分解前面体,关键在于帮助增加繁殖。无论怎样具备有根本含义,但肿癌组织人体细胞上浮糖酵解的管理机制仍不能掌握。

近日,南京市医学院专业第一点附屬医疗王学浩中科院院士公司在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶点力量基础代谢检测分析服务。

用英文怎么说版头:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)

2英文文章标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路

顾客工作单位:南京医科大学

调查材质:细胞

拜谱作为服务项目:转录组测序+蛋白质互作组+靶向治疗能量转换新陈代谢组

技術风格:

研发最终结果

01、YBX1被判定为HCC中糖酵解的根本什么是基因

本试验录入HCC肺部肺部恶性癌肿样例(n=7)的单生殖癌人体细胞RNA测序大数据文件集实现探讨,出现糖酵解吸附性重要分散在肺部肺部恶性癌肿生殖癌人体细胞中,hdWGCNA探讨分辨出9个人类基因传感器(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的求生探讨选择YBX1为独立的求生危险因素分析因素分析(图1H)。全面骤构建IHC、WB试验和肺部肺部恶性癌肿团体性与附近非肺部肺部恶性癌肿团体性的发展空间转录组学大数据文件集表明YBX1是肝生殖癌人体细胞癌缓解的风险靶点(图1I-K)。

图1:YBX1被知道为的调节HCC細胞糖酵解的关健条件

02、YBX1可以淡化HCC中的有氧糖酵解和增值

为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物体力分解代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。

图2:YBX1带动HCC中的有氧糖酵解和繁殖

03、OGT与YBX1配合并促使YBX1的O-GlcNAc糖基化

为了识别YBX1的调控因子,蛋白质互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。

图3:OGT与YBX1搭配并增进YBX1的O-GlcNAc糖基化

04、YBX1的O-GlcNAc糖基化提高其磷硝化作用,若想提高其核转位

逐渐骤探测YBX1的O-GlcNAc糖基化可否直接影响其磷酸性反应,在OGT敲低的HCC人体组织细胞中或用OGT遏注射剂OSMI-1加工,YBX1蛋清质品质明显大大以减少,YBX1磷酸性反应明显以减少(图4A-C)。IP实验英文呈现,在相同之处的Flag-YBX1底物品质下,YBX1-WT的磷酸性反应品质明显要高于YBX1-T57A,证实磷酸性反应的加入一方面仅是根据高的YBX1蛋清质理解(图4D)。溶合了核和质混合物出现TMG加工的HCC人体组织细胞中YBX1核理解的变高(图4E-F),逐渐骤出现YBX1磷酸性反应的关键因素控制要素是AKT(图4G-I)。他们出现突出O-GlcNAc糖基化借助推动其磷酸性反应来带动YBX1蛋清质固相关性并推动核转位。

图 4.YBX1的 O-GlcNAc 淡化有益于于其进这一步进行磷过酸淡化并就可以力促其核转位

05、YBX1推进PKM2转录

前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。

图 5.YBX1加速PKM2转录

06、YBX1 才能的提升组蛋清乳硝化作用绘制平行

科研得知YBX1敲低特殊大幅度消减淀粉酶质乳酸性反应,更是是H3K18乳酸性反应(图6A-C)。糖酵解治理和改善剂2-DG的实验所证明了糖酵解与组淀粉酶乳酸性反应的真接绑定,治理和改善糖酵解可特殊大幅度消减H3K18la程度(图6D)。PKM2过表明可逆反应转YBX1敲低伴发的H3K18la降低,之外源乳酸操作往往增加H3K18la,还引起YBX1表明调整,表示存有正向着回访(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR证明,H3K18la顺利通过丰度于YBX1通电子真接有助于其转录,该工作受O-GlcNAc糖基化政策调控(图6H-J),并得知P300 调整是YBX1增强学习H3K18乳酰化做用的工作机制(图6K-L)。

图6.YBX1增強H3K18乳碱化体现层次

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在此种研究分析中通讯稿了YBX1在HCC中高把你想表达出来出来,才能与糖酵破译切关于。YBX1在T57处被O-GlcNAc突显,才能平衡脂肪酸质并新增其把你想表达出来出来。此种突显还加速YBX1在T57处的磷过酸,加速其核易位。对此,此工作加强了糖酵解关于什么是基因遗传的转录并伤害性乳酸的导致。还有,YBX1修改密码P300的转录,因此安装驱动组脂肪酸的乳过酸,非常是H3K18la,H3K18乳过酸同向宏观调控YBX1什么是基因遗传转录(图7)。

图7.Y糖酵解-表观遗传的正反两面馈环制度图

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本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱动物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向疗法能量是什么分解组技术服务,拜谱菌物建立了完善成熟的转录组学、蛋白酶组学、翻译专业后呈现组学、排泄组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!

考生文献综述

Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.
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