
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC免疫抗体聚集MHC试述根据肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫抗体肽编码序列或翻译专业后修饰语信心,提高基因测序的真实度,并采用De novo重头测序枝术,不依赖现有数据库,更加高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且丰富多样的数据源进行分析的内容为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递癌肿抗原的方式
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例了解
01 策略探析
论文大题目:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
刊登半月刊:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)有的是种核所在核蛋白,在癌证中总是过抒发,并且做好为肿癌再次发生的驱动包因素分析。如今,靶向中成药XPO1的小团伙正被应用于诊疗抗肿瘤中成药。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用天然免疫肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 一类原于XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 癌症-免疫细胞控制
句子试题:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
发表过杂物:Nature Communications IF:16.6 2023
恶变胸膜间皮瘤(MPM)有的是种愈后欠佳的侵蚀性性良性肿瘤。上述情况替换成的疗法设计没有诊疗效果,于是亟待解决需新的疗法手段。上述情况其T癌细胞浸润性,作家有效市场理论MPM有的是个适于的疗法性肿瘤狂犬疫苗的目标值。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用系统设计质谱的免疫力肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 恶意胸膜间皮瘤免疫抗体肽组学探测
03 结核杆菌mRNA役苗开发设计
原创文章提题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
收录期刊:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过体系结构质谱的免疫力肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌妇科感染的Hela人体组织细胞和HCT-116人体组织细胞中评定MHC I呈递的抗原肽。
拜谱工作小结
天然免疫癌细胞性性癌上皮神经癌细胞系统性肽组学是核淀粉酶组学的一些最快发展壮大的派系,它专心致志于探讨天然免疫癌细胞性性癌上皮神经癌细胞系统性体系中由注意结构性相融性和好体(MHC)或人类白受损癌上皮神经癌细胞抗原(HLA)碳原子呈递的天然免疫癌细胞性性癌上皮神经癌细胞系统性肽。等等天然免疫癌细胞性性癌上皮神经癌细胞系统性肽是受损癌上皮神经癌细胞表明呈递的肽段,够被T受损癌上皮神经癌细胞甄别,可以引起天然免疫癌细胞性性癌上皮神经癌细胞系统性现象。通过质谱的天然免疫癌细胞性性癌上皮神经癌细胞系统性肽组学己经为司法签定MHC核淀粉酶呈递肽的金标准规范工艺,够直接性司法签定有差异生理上和病理报告情形下有差异结构性和受损癌上皮神经癌细胞款式中的天然免疫癌细胞性性癌上皮神经癌细胞系统性肽组,举例说明三维线瘤或木马感化的受损癌上皮神经癌细胞。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的球蛋白组学、细胞代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫细胞肽组论文测试服务项目,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,就能够更准确且马上可以提供免疫性抗体肽队列,看见很多非典范免疫性抗体肽,逐渐挑选出信得过新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
借鉴文献综述
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y